Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim65Q8BFW4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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