Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms