Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q80Y73 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q80Y73 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q80Y73 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q80Y73 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q80Y73 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q80Y73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms