Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnma8aQ80VM8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms