Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms