Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN22

Txndc16, Thioredoxin domain-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc16Q7TN22 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Txndc16Q7TN22 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms