Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms