Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms