Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrm2bQ6PEE3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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