Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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