Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms