Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt77Q6IFZ6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt77Q6IFZ6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms