Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atg9aQ68FE2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg9aQ68FE2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9aQ68FE2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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