Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptpn13Q64512 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms