Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Zfp248Q640N4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp248Q640N4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp248Q640N4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp248Q640N4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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