Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc18Q640L5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc18Q640L5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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