Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Six3Q62233 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Six3Q62233 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Six3Q62233 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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