Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms