Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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