Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha7Q61772 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms