Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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