Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms