Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epha1Q60750 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epha1Q60750 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms