Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a1Q60714 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms