Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr1Q5SWD9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms