Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms