Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms