Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fam208bQ5DTT3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Fam208bQ5DTT3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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