Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syne3Q4FZC9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms