Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Defa20Q45VN2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms