Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2Q3V1H1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2Q3V1H1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms