Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmprss12Q3V0Q7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmprss12Q3V0Q7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms