Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms