Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Ulk3Q3U3Q1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Ulk3Q3U3Q1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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