Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud5Q3U2S4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Otud5Q3U2S4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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