Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms