Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms