Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pde12Q3TIU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms