Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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