Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cpne9Q1RLL3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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