Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc39dQ0VF76 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39dQ0VF76 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms