Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms