Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Thbs3Q05895 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Thbs3Q05895 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Thbs3Q05895 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Thbs3Q05895 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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