Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms