Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms