Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms