Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf2raQ00941 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms