Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms