Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms