Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PgrQ00175 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms